Словарь нанотехнологий
Протеомика

По первой букве
A-Z А Б В Г Д Ж З И К Л М Н О П Р С Т У Ф Х Ц Ш Э Я

Протеомика

Термин

протеомика

Термин на английском

proteomics

Связанные термины

активный центр катализатора, антитело, атомно-силовая микроскопия, белки, биологические моторы, биологические нанообъекты, биосенсор, ван-дер-ваальсово взаимодействие, водородная связь, высокоэффективная жидкостная хроматография, диализ, кинезин, клетка, константа равновесия реакции, масс-спектрометр, масс-спектрометрия вторичных ионов, масс-спектрометрия с лазерной десорбцией и ионизацией, матрикс, внеклеточный, нанолекарство, нанофармакология, олигопептид, протеом, фермент, хроматография, электронная микроскопия, электронный микроскоп, ядерный магнитный резонанс

Определение

Наука, изучающая белковый состав биологических объектов, а также модификации и структурно-функциональные свойства белковых молекул

Описание

Протеомный анализ направлен на одновременное изучение многих индивидуальных белков, совокупность которых составляет определенную систему, что характеризует исследуемый объект в целом. Предметом изучения протеомики являются синтез, модификация, декомпозиция и замена белков исследуемого объекта. После расшифровки генома человека и геномов многих других организмов, появились исчерпывающие базы данных о структуре всех белков человека и многих других организмов, а также их протеолитических фрагментов, полученных в стандартных условиях, что позволяет идентифицировать белки по молекулярной массе их протеолитических фрагментов. Развитие протеомики обусловлено использованием высокотехнологичных методов, позволяющих определить количество того или иного белка в образце, идентифицировать белок, его первичную структуру и пост-трансляционные модификации. В настоящее время большая часть работ в протеомике выполняется с использованием метода 2-D PAGE (двумерного гель-электрофореза в полиакриламиде). Однако в последнее десятилетие получают все более широкое применение высокотехнологичные методы, обладающие большей эффективностью, информативностью и чувствительностью, такие как микросеквенирование белков, жидкостная хроматография высокого давления (HPLC), масс-спектрометрия, а также использование белковых чипов с различными типами детекции, таких как SELDI Protein Chip. Протеиновые чипы основаны на связывании определенных белков со специфически взаимодействующими или связывающимися с ними молекулами. Взаимодействие может строиться по типу антиген-антитело, рецептор-лиганд, ДНК-белок, белок-белок, фермент-субстрат или белок-липид. Чипы считываются путем Surface-Enhanced Laser Desorption/Ionization (лазерная десорбция/ионизация - SELDI) с помощью специального устройства и идентифицируются с помощью времяпролетной масс-спектрометрии. В настоящее время в медицине применение методов протеомного анализа позволяет выявить маркеры кардиоваскулярных и онкологических заболеваний на ранней стадии заболевания (клиническая протеомика). Клиническая протеомика - это идентификация и количественное определение всех индивидуальных белков, которые содержатся в биологическом образце (сыворотка крови, спинномозговая жидкость, моча, ткань) и мониторинг изменения их концентраций. Методы протеомного анализа позволяют проанализировать до 10 000 индивидуальных белков в одном образце и зафиксировать изменения их концентраций, что позволяет проводить диагностику и мониторинг течения заболевания.

Авторы

Народицкий Борис Савельевич, д.б.н.
Ширинский Владимир Павлович, д.б.н.
Нестеренко Людмила Николаевна, к.б.н.

Ссылки

Арчаков А.И. Биоинформатика, геномика и протеомика - науки о жизни XXI столетия / Вопросы медицинской химии, № 1, 2000. URL: http://medi.ru/pbmc/8800101.htm (дата обращения 12.10.2009)
Conrotto P., Souchelnytskyi S. Proteomic approaches in biological and medical sciences: principles and applications // Exp. Oncol. - № 30(3), 2008 - P. 171-180.
Reddy G., Dalmasso E. A. SELDI ProteinChip® Array Technology: Protein-Based Predictive // Medicine and Drug Discovery Applications. Biomed Biotechnol. - № 4, 2003 - P. 237-241.

Разделы

Молекулярные моторы

Биомиметические наноматериалы

Лекарственные наноматериалы

Диагностические методы с применением фиксированных наноструктур

Выделение и иммобилизация биологических веществ с применением наноматериалов

Молекулярное распознавание c применением наноматериалов

Ферментные сенсоры и другие биосенсоры

Контроль и тестирование биосовместимости и безопасности наноматериалов

Тестирование функциональных свойств и их стабильности (указать: каталитических, деградационных, механических, трибологических, биологической активности и т.п.)

Масс-спектрометрия

Магнитно-резонансные методы